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Projekte
Fraunhofer-Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen SCAI
Informationsextraktion/Semantische Textanalyse
- Neuroallianz D10
Zielsetzung des Projekts D10 ist die Identifikation biologischer Marker, die zur Förderung der Arzneimittelentwicklung und Verbesserung therapeutischer Interventionsmöglichkeiten bei neurodegenerativen Erkrankungen eingesetzt werden können. Das Projekt wird in Zusammenarbeit von UCB Pharma GmbH und dem Fraunhofer Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen (Fraunhofer SCAI) durchgeführt und beruht prinzipiell auf einer rechnergestützten Strategie zur Biomarker-Ermittlung.
- Neuroallianz I2
Um dem Biotechnologie- und Pharmastandort Deutschland neue Impulse zu geben, hat das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) die Pharma-Initiative »BioPharma: Für die Medizin der Zukunft« gestartet. Das für diese Initiative nominierte Neuroallianz-Konsortium hat ein neuartiges strategisches Partnerschaftsmodell entworfen, bei dem akademische Institutionen und Pharmaunternehmen eine Reihe diagnostischer und therapeutischer Forschungsprojekte bearbeiten.
- Open PHACTS
To reduce the barriers to drug discovery in industry, academia and for small businesses, the Open PHACTS consortium is building an Open Pharmacological Space (OPS). This will be a freely available platform, integrating pharmacological data from a variety of information resources and providing tools and services to question this integrated data to support pharmacological research. It is a 3-year project ending in March 2014.
- +Spaces
In governmental models public opinion is often measured with traditional methods like telephone or street surveys. The dynamicity in society can only be captured with tremendous effort. The EC-funded project +Spaces (dubbed "Positive Spaces") aims at the use of popular online communities in which people literally live: platforms like Facebook, Twitter, Blogger, or Open Wonderland.
Abgeschlossene Projekte
- @neurIST
When considered separately from other cardiovascular diseases, stroke ranks third among all causes of death, after heart disease and cancer. Worldwide, 3 million women and 2.5 million men die each year from stroke. Hemorrhagic stroke occurs when a blood vessel, typically an aneurysm, ruptures inside the brain. This often leads to severe disability or death. Despite considerable advances in treatment, rupture is associated with exceptionally high levels of morbidity and mortality (about 33% in each case).
- SIMDAT
Im Projekts SIMDAT werden grundlegende Techniken für das Grid-Computing entwickelt. Ziel dabei ist es, komplexe Anwendungsprobleme in unterschiedlichen Industriebereichen zu lösen: im Entwurf von Automobilen und Flugzeugen, in der Pharmaindustrie und in der Meteorologie. Dabei helfen Technologien aus folgenden sieben Forschungsgebieten: Integrierte Grid-Infrastrukturen, Verteilter Datenzugriff, Management virtueller Organisationen, Workflow, Ontologien, Dienste-Integration und Knowledge Discovery.
- THESEUS
THESEUS ist ein vom Bundesministerium für Wirtschaft und Technologie (BMWi) initiiertes Forschungsprogramm mit dem Ziel, eine neue internetbasierte Wissensinfrastruktur zu entwickeln, um das Wissen im Internet besser zu nutzen und zu verwerten.
Angewandte Chemoinformatik
HPC und Cloud Computing
- cloud4health
Within the Cloud4Health project, SCAI focuses on a secure platform for text-mining workflows that can easily and efficiently be deployed in private and public Cloud infrastructures. SCAI designs and implements processes and workflows for text-mining on clinical data, providing the resulting text-mining platform to users from participating clinics. The platform will be made available to external users after the end of the project. This includes setting up and providing the initial Cloud IaaS infrastructure for the text-mining platform to be developed. Furthermore, SCAI implements the mechanisms to protect the data from unauthorised access, provides the mechanisms for authentication and authorisation for accessing data.
- OPTIMIS
OPTIMIS is a “software infrastructure-as-a-service” offering that enables organizations to automatically externalize services and applications to best-execution venues in the hybrid cloud model. SCAI´s major contributions to the OPTIMIS toolkit are
- UIMA HPC
Die unglaubliche und weltweit ständig wachsende Fülle von Fachartikeln, Patenten und anderen Nachrichtenquellen (wie z.B. Blogs) ruft sozusagen nach einem automatischen Lesen und Auswerten. So enthält die Literaturreferenzdatenbank PubMed derzeit mehr als 20 Millionen Einträge auf dem biologisch-pharmakologischen Gebiet.
Abgeschlossene Projekte
- CoreGRID
CoreGRID ist ein europäisches Forschungsnetzwerk zur Erforschung der Grundlagen, Softwareinfrastrukturen und Anwendungen von großen verteilten Systemen sowie GRID- und Peer-to-Peer-Netzwerken. In diesem »Network of Excellence« (NoE) arbeiten zahlreiche der besten europäischen Forschungsgruppen in der Art eines »Think Tank« an der Erforschung von Grid-Technologien. Zu diesem durch die Europäische Union geförderten NoE gehören 42 Partner aus 18 Ländern Europas.
- D-Grid
Seit dem Beginn des D-Grid Projektes am 1. September 2005 arbeiten sechs Community-Projekte und das D-Grid Integrationsprojekt am Aufbau einer nachhaltigen Grid-Infrastruktur für Deutschland. Aktuell werden mehr als 15 Community-Projekte in verschiedenen Anwendungsbereichen durchgeführt, deren Anwendungsbereiche sich von Hochenergiephysik bis zu Finanzdiensten erstrecken. Die Projekte nutzen diese Infrastruktur und ergänzen sie mit eigenen, Community-spezifischen Entwicklungen.
- DGSI
Ein Vorteil von grossen Föderationen von Forschungsgemeinschaften (Communities) mit unterschiedlichen, heterogenen Ressourcen wie dem D-Grid liegt in der Möglichkeit, Ressourcen bei Bedarf gemeinsam zu nutzen, um eigene Kapazitätsengpässe oder Anforderungen hinsichtlich spezieller Eigenschaften der Ressourcen, die nicht lokal erfüllt werden können, durch die Nutzung von Ressourcen einer anderen Community auszugleichen.
- IVOM
In modernen Gridumgebungen werden verschiedene Technologien zur Autorisierung eingesetzt, im Wesentlichen rollenbasierte und attributbasierte Techniken. Die Unterstützung für diese Technologien variiert jedoch zwischen den eingesetzten Middleware-Systemen. Die Möglichkeiten der Interoperabilität zwischen den unterschiedlichen Ansätzen sind üblicherweise nur beschränkt oder gar nicht vorhanden.
- PHOSPHORUS
Aktuell entsteht eine neue Generation wissenschaftlicher Anwendungen, welche wissenschaftliche Instrumente sowie global verteilte Daten- und Rechenressourcen bündelt und gemeinsam nutzt. Diese in Virtuellen Organisationen gemeinsam entwickelten Anwendungen definieren Anforderungen unter anderem hinsichtlich Zuverlässigkeit (beispielsweise durch garantierte QoS), gemeinsam genutzten Datenspeichern sowie großen Datentransfers, die häufig nur durch dedizierte Bandbreiten optischer Netzwerke erreicht werden können.
- SmartLM
Die heutige Praxis für Gestaltung und Gebrauch von Softwarelizenzen behindert die Ausbreitung und Nutzung von Technologien des verteilten Rechnens, wie etwa Grid Computing, im nicht-akademischen Umfeld. Gleichzeitig erfordert die rasante Verbreitung von Service- und Virtualisierungsumgebungen eine schnelle Evolution der Lizenzmodelle, um mit Softwarelizenzen geschützte kommerzielle Anwendungen auch in diesem Umfeld nutzen zu können.
- SLA4D-Grid
Die heutige Praxis für Gestaltung und Gebrauch von Softwarelizenzen behindert die Ausbreitung und Nutzung von Technologien des verteilten Rechnens, wie etwa Grid Computing, im nicht-akademischen Umfeld. Gleichzeitig erfordert die rasante Verbreitung von Service- und Virtualisierungsumgebungen eine schnelle Evolution der Lizenzmodelle, um mit Softwarelizenzen geschützte kommerzielle Anwendungen auch in diesem Umfeld nutzen zu können.
- VIOLA
VIOLA ist ein vom Bundesforschungsministerium gefördertes Verbundprojekt mit Partnern aus Hochschulen, Forschungseinrichtungen, Industrieunternehmen und dem Verein zur Förderung eines Deutschen Forschungsnetzes e.V. (DFN). Ziel des Projektes ist es, in einem Testbett neue Netztechniken und Formen der Netzintelligenz einzusetzen, sie integriert mit anspruchsvollen Anwendungen zu erproben und den beteiligten Partnern Know-how für künftige Netzgenerationen zu vermitteln.
- VO-Management
Vertrauenswürdige Authentisierung und Autorisierung sind wichtige Anforderungen sowohl für Ressourcen- und Diensteanbieter als auch für deren Nutzer im Grid. Die Anbieter können dadurch ihre Ressourcen vor unautorisierten Zugriffen schützen, während die Nutzer sicher sein wollen, dass unautorisierter Zugriff auf ihre Daten verhindert wird.
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