Fraunhofer-Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen SCAI
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Software im Geschäftsfeld Bioinformatik

 

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ProMiner

Die Software ProMiner identifiziert Gen- und Proteinnamen in wissenschaftlichen Texten. Die Identifikation basiert auf automatisch erzeugten Wörterbüchern. Das Wörterbuch von ProMiner zu »Homo Sapiens« umfasst bereits 18.000 Einträge und 270.000 Synonyme.

 

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SCAIView

SCAIView ist eine Knowledge-Discovery-Software für die Life Sciences. Sie erlaubt das schnelle Auffinden von aggregierten Informationen aus großen Textmengen. Dazu integriert SCAIView die Information von ProMiner mit den dazugehörigen Texten und erlaubt eine semantische Suche.

 

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chemoCR

chemoCR (Tool for Chemical Compound Reconstruction) erkennt chemische Strukturformeln und deren Abbildungen in wissenschaftlichen Texten. Die Software wandelt die Abbildungen in ein Format um, mit dem ein Computer die Informationen aus den Formelabbildungen verarbeiten kann.

 

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elasticLM

elasticLM ist ein innovatives Werkzeug für das Erzeugen und Verwalten von Softwarelizenzen. Entwickelt für verteilte Rechnerinfrastrukturen, wie Grids und Clouds, bietet elasticLM alle Vorteile auch für Anwendungen, die auf lokalen Ressourcen ausgeführt werden, wie zum Beispiel Workstations oder Cluster.

 

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BELIEF

BEL Information Extraction workFlow. BELIEF ist eine Web-basierte Anwendung um kausale Relationen aus englischen wissenschaftlichen Texten zu extrahieren.  Hochgeladene Texte werden direkt an eine Textmining-Pipeline geschickt und nach  dem Prozessieren auf der Kurierungseite dargestellt. Die Ergebnisse werden in der Modellierungssprache BEL (Biological Expression Language) angezeigt und können vor Abspeicherung  von den Nutzern korrigiert werden.

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